O comando Compactar Agora do próprio Outlook só recupera o espaço vazio, então, quando um arquivo de dados está cheio de e-mails, ele quase não faz diferença. A divisão separa esse arquivo pesado em vários PSTs menores, cada um pequeno o bastante para abrir rápido e ter o seu próprio backup.
Você mantém todas as mensagens, distribuídas em partes que você mesmo nomeia. Aponte o Outlook para as partes que ainda usa no dia a dia e guarde o resto.